המוזיאון מספר את סיפורו של כלא עכו המנדטורי (1920-1948) מנקודת מבטם של אסירי המחתרות – ה"הגנה", האצ"ל ולח"י.
המוזיאון מציע סיור חדשני וחווייתי בכלא הכולל הדרכה, סרטים, מוצגים מקוריים, תפאורה ואפקטים.
המוזיאון ממוקם במבצר עכו, שנבנה בסוף המאה ה-18 בידי דאהר אל עומאר, השליט הבדווי של הגליל, על חורבותיהם של מבנים צלבניים מהמאה ה-12.
המבצר שימש בתחילה כבית ממשל (סראיה) ואחר כך, כבית כלא וקסרקטין, וכן כמחסן נשק לחיל המצב העות'מני בעכו.
בראשית המאה העשרים נכלאו, כאן, בידי השלטון העות'מני אחדים מחברי ארגון "השומר".
בתקופת המנדט הבריטי שימש המבצר כבית הכלא המרכזי בצפון הארץ, ונכלאו בו מאות מחברי ה"הגנה", האצ"ל ולח"י, לצד אסירים פליליים ערבים ויהודים.
בשנת 1920 נכלא, כאן, המנהיג הציוני זאב ז'בוטינסקי, מפקד ההגנה היהודית בירושלים. יחד עמו נכלאו 19 מחבריו, מגיני העיר במאורעות ניסן תר"ף (אפריל 1920).
בתחילת שנות השלושים היו עצורים, כאן, עולים בלתי לגליים. בשנים 1937-1938 נוספו עליהם כ-200 חברי התנועה הרוויזיוניסטית, שנעצרו על פי התקנות לשעת חירום של ממשלת המנדט.
בשנת 1939 נכלאו בכלא עכו 43 חניכי קורס מפקדי מחלקות של ה"הגנה" ביבנאל, 10 חברי ה"הגנה" מקיבוץ גינוסר ו-38 חניכי קורס מפקדים של האצ"ל במשמר הירדן.
קבוצות מרכזיות שנכלאו בעכו במהלך שנות ה-40': "נערי שוני" (אצ"ל), "אסירי ביריה" (פלמ"ח), "אסירי בתי המלאכה של הרכבת" (לח"י) ו"אסירי חולות בת- ים" (אצ"ל).
ב-4 במאי 1947 פרצו לוחמי האצ"ל אל הכלא בפעולה נועזת שתואמה עם חבריהם האסירים. בפריצה נמלטו 30 אסירים חברי אצ"ל ו-11 חברי לח"י. בקרב שהתפתח מחוץ לתחומי הכלא, מול כוחות בריטיים, נהרגו 3 מאנשי הכוח הפורץ ו-6 מבין האסירים המשוחררים.
בין הנופלים היה מפקד הפעולה גונדר דב כהן ("שמשון"). 8 מהבורחים נתפסו ועמם 5 מחברי האצ"ל שהיו בכוח הפורץ. 3 מאנשי הכוח הפורץ שנתפסו נידונו למוות והוצאו להורג בכלא עכו.
בכלא עכו הועלו לגרדום שמונה חברי אצ"ל ואחד חבר ה"הגנה": שלמה בן יוסף, מרדכי שוורץ ("הגנה"), דב גרונר, יחיאל דב דרזנר (רוזנבאום), אליעזר קשאני, מרדכי אלקחי, יעקב וייס, אבשלום חביב ומאיר נקר.
במוזיאון הוקמה תצוגה חדשנית המתארת את נסיבות כליאתם של חברי ה"הגנה", האצ"ל ולח"י, אורח חייהם בכלא, סיפור פריצת כלא עכו וסיפורם של עולי הגרדום. הסיור מדגיש את מאבקם של לוחמי המחתרות להקמת בית לאומי לעם היהודי בארץ ישראל ואת הערכים המרכזיים שלאורם פעלו – ציונות, אהבת הארץ, גבורה והקרבה.